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期刊信息
期刊名称：沈阳农业大学学报
创办日期：1956年6月
主管部门：辽宁省教育厅
主办单位：沈阳农业大学
刊期：双月刊
电话：024-88487083
Email：syndxb@126.com
国内统一刊号(CN)： 21-1134/S
国际标准刊号(ISSN)：1000-1700
辽宁省甜椒内源RNA病毒的鉴定、基因组全长序列扩增及系统进化分析
夏子豪;韩佳芮;郭慧妍;王志平;安梦楠;吴元华;[目的]从辽宁省沈阳市采集疑似病毒侵染的辣椒样本，通过小RNA深度测序技术检测出样品含有甜椒内源RNA病毒(Bell Pepper Alphaendornavirus, BPEV)，命名为BPEV-Liaoning(BPEV-LN)。对其内源RNA病毒的鉴定、基因组全长序列扩增及系统进化分析。[方法]利用逆转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription-polymerase Chain Reaction, RT-PCR)方法，对BPEV-LN基因组进行分段扩增，最终获得14 728 bp的全长序列(GenBank登录号：PP842643)。[结果]核苷酸序列同源性分析表明，BPEV-LN与来自新疆的分离物BPEV-XJ(MH182675.1)同源性最高，为99.21%。进化树分析结果表明，BPEV-LN与BPEV-XJ分离物聚为一支，其亲缘关系最近。此外，根据BPEV的RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA Polymerase, RdRp)序列设计检测引物，对同一地点采集到的疑似病毒侵染的19份辣椒样本进行检测，其中17份检出BPEV。[结论]首次在辽宁省鉴定到BPEV，获得了BPEV-LN的基因组全长序列，并建立了RT-PCR检测方法，为BPEV的溯源和防控提供了理论依据，也为BPEV的鉴定和检测提供了技术支持。
OsDGL1介导的细胞壁鼠李糖代谢参与调控水稻对缺氮诱导的初生根伸长响应
袁陈;张燕莉;赵明辉;马殿荣;[目的]植物在缺氮条件下可通过促进初生根生长增强对氮源的吸收，但其分子机制尚未明晰。旨在揭示水稻响应氮缺乏时根系形态适应的内在机理，以阐明初生根生长调控与氮素吸收效率之间的关联。[方法]以水稻野生型与Osdgl1突变体为试验材料，设置正常供氮与缺氮处理,观察并测定初生根生长表型，同时分析根系细胞壁主要成分（包括鼠李糖、木糖和纤维素）的含量变化。[结果]缺氮处理显著促进水稻初生根伸长，并部分恢复Osdgl1突变体的短根表型。遗传证据表明OsDGL1在缺氮诱导的根系生长过程中发挥关键作用。进一步分析发现，根系长度变化主要与细胞壁中鼠李糖与木糖的含量相关，而与纤维素无关，表明鼠李糖生物合成可能在该过程中起重要作用。[结论]OsDGL1可能通过调控鼠李糖的生物合成途径，介导缺氮条件下水稻初生根的生长响应。为解析氮素缺乏调控水稻根系发育的分子机制提供了新的线索与研究方向。
大豆种质资源遗传多样性及开花期性状分析
杨光;吕世翔;张微;李炜;刘建新;刘淼;樊超;梁文卫;邸树峰;丁国华;毕影东;[目的]系统解析大豆种质资源的遗传多样性及开花期性状的遗传基础，筛选在开花期与遗传背景上具有互补性的种质资源，为大豆生态适应性改良和分子设计育种提供理论依据。[方法]以294份大豆栽培品种及中间种质为材料，利用180K基因芯片进行全基因组测序，通过主成分分析、聚类分析、遗传距离与遗传相似度计算，结合亲缘关系矩阵分析群体结构及开花期遗传力。[结果]294份大豆种质资源开花期变异范围为36～69 d，均值为41 d，变异系数15.688%，遗传力为0.42。经质量控制筛选可获得71 880个SNP，主成分分析显示PC1和PC2主成分累计解释表型变异的12.05%。聚类分析将294份大豆资源分为3大类群，类群一细分为4个亚群，其中类群一包含261份材料，类群二、三规模较小但遗传分化明显。遗传距离分析揭示材料间遗传距离范围为0.000 578～0.491 218，平均遗传距离为0.249 783。遗传相似度分析表明材料间平均遗传相似度为0.745 1。遗传距离最大和最小的材料间开花期差异分别达24 d和8 d，类群间开花期表型存在显著差异。[结论]294份大豆种质资源在开花期上具有丰富的表型变异和中等遗传力，群体遗传结构清晰，部分类群保留了独特基因库，与主流育成品种存在显著遗传分化。研究结果为大豆开花期相关基因挖掘、利用遗传互补性选配亲本、定向改良大豆生态适应性提供了重要数据支持和理论依据。
沈阳地区板栗种质资源筛选与评价
秦嗣军;任新然;何美琦;徐功勋;何佳丽;[目的]为丰富沈阳地区板栗资源，对课题组前期筛选出的10株优良单株进行系统观察、评价，以期从中筛选可在沈阳地区栽培，具有连续结果能力的候选单株。[方法]测定板栗的物候期、形态性状、果实性状及主要营养成分等指标，采用主成分分析法对2024年测定数据进行综合评价，并对比分析连续2年（2023—2024年）的性状变化趋势。[结果]10株板栗萌芽期集中在4月中下旬，果实成熟期集中在9月中下旬，2年间物候期较为稳定；23-1-8在营养品质方面表现突出，其含水量（55.43%）、淀粉含量（36.63%）、可溶性糖含量（10.71%）及蛋白质含量（4.97%）均较优；23-2-1则表现出优异的综合品质与果实性状，在刺苞大小（纵径9.02 cm、横径8.41 cm）及单果重（13.65 g）最大的同时，其叶片、花序、果实大小、枝条及营养含量等综合指标优于大部分单株，主成分综合评价得分为0.899，在10个单株中排名第一。[结论]结合树体生长势、产量与品质等综合表现，将23-2-1和23-1-8确定为优良候选单株，可作为沈阳地区板栗优良品种选育的重点评价对象。
贝莱斯芽孢杆菌Apcs-1全基因组测序分析及对土壤微生物的影响
王凤鹭;魏玮;王艳平;贾景丽;李诗瑶;石玉立;张崇;贾立君;吴元华;[目的]前期研究中，课题组获得1株对马铃薯疮痂病具有显著抑菌活性和防治效果的贝莱斯芽孢杆菌Apcs-1。为进一步解析其生防作用机制。[方法]对该菌株Apcs-1进行全基因组测序分析，同时对施用生防菌后对土壤微生物菌群影响进行了测定。[结果]菌株Apcs-1基因组序列全长3 929 735 bp,GC含量46.50%，该菌株含有与抗生、促生诱导抗性等多种生防相关的功能基因；通过antiSMASH预测到菌株具有脂肽类、聚酮类、铁载体类等丰富的次级代谢产物合成基因簇，具备产生多种抗菌活性物质的潜力。VFDB数据库预测发现菌株具有防御性毒力因子、非特异性毒力因子、攻击性毒力因子、毒力相关调控基因。进一步对施用菌株发酵液处理后的根际土壤微生物群落分析表明，Apcs-1能够显著提升根际有益微生物(如放线菌门Actinobacteria、芽孢杆菌纲Bacilli等)的丰度与群落均匀度，并在土壤中显著富集氨基酸代谢、糖类代谢等关键代谢通路相关基因。[结论]从基因组和对微生物群落影响层面揭示了菌株Apcs-1的生防功能基础，为菌株在马铃薯疮痂病绿色防控中的开发应用提供了理论依据。
